博士研究生
微软学者奖
首 届 (1999年) 周志华
第二届 (2000年) 杨凡
第三届 (2001年) 苏丰
第四届 (2002年) 姜远
第五届 (2003年) 裴玉
第六届 (2004年) 张敏灵
第七届 (2005年) 黎铭
第九届 (2007年) 刘胥影 俞扬
第十一届 (2009年) 李宇峰 王巍
全国优秀博士论文
周志华 2003
宋继强 2004
中国计算机学会优秀博士论文（2006年首届）
黎 铭 2009
张敏灵 2008
江苏省优秀博士论文
张敏灵 2009
谭晓阳 2007
马晓星 2005
南京大学优秀博士学位论文
刘 明 2008
谭晓阳 2007
路 通 2006